20-21 juin 2022 PARIS (France)

Programme AGFG 2022


Programme

 

Lundi 20 Juin 2022

 

10:00 - 12:30       Session management PFs noyau (avec les Managers des PF du noyau) - Patrick Wincker et Denis Milan 

12:30 - 13:30       Déjeuner (seulement pour les managers du noyau)

13:00 - 13:30       Accueil

13:30 - 14:30       France Génomique – Patrick Wincker et Denis Milan              

14:30 - 15:30       Présentation des 6 nouvelles PF du réseau (8 min/PF + 2 min de questions)

14:30 - 14:40 › Go@l, Martin Figeac

14:40 - 14:50 › Genomax, Anne Militor

14:50 - 15:00 › iGenSeq, Yannick Marie

15:00 - 15:10 › AuBi, Pierre Peyret

15:10 - 15:20 › ARTbio, Christophe Antoniewski

15:20 - 15:30 › ABIMS, Erwan Corre

15:30 - 15:45       Posters technologiques : présentation « flash » (1min, 1 slide/poster)

15:45 - 16:15       Pause-café

16:15 - 17:15      Session management PFs du réseau (avec les Managers des PFs noyau + associées) 

                             Patrick Wincker et Denis Milan

16:15 - 17:15       Session poster en parallèle pour les ingénieurs

17:30 - 19:00       Point développement des PFs (8 min/PF + 2 min de questions)

17:30 - 17:40 › GENTYANE

17:40 - 17:50 › ICGex

17:50 - 18:00 › GenomEast

18:00 - 18:10 › POPS

18:10 - 18:20 › GenomiqueENS

18:20 - 18:30 › PGTB

18:30 - 18:40 › GeT-PlaGe

18:40 - 18:50 › LIGAN

18:50 - 19:00 › CNRGH

 19:00 - 20:00       Enregistrement à l'hôtel Ibis Styles Paris Masséna Olympiades - 82 Rue Regnault, 75013 Paris

20:00 - 22:00       Dîner convivial L’Auberge Aveyronnaise – 40 Rue Gabriel Lamé, 75012 Paris


Mardi 21 Juin 2022

08:30 - 09:00       Accueil

09:00 - 10:20       Point développement des PFs (8 min/PF + 2 min de questions)

09:00 - 09:10 › Genoscope

09:10 - 09:20 › Biomics

09:20 - 09:30 › MGX

09:30 - 09:40 › Genom’IC

09:40 - 09:50 › PSI2BC

09:50 - 10:00 › ProfileXpert

10:00 - 10:10 › TGML

10:10 - 10:20 › UCAGenomiX

10:20 – 10:50      Pause-café

10:50 - 11:30       Session Adaptive sampling (10min/intervenant), chaired by Cécile Donnadieu, GeT-PlaGe

10:50 - 11:00 › Adaptive sampling development from drylab perspective – Dimitri Desvillechabrol, Biomics

11:00 - 11:10 › L'adaptive sampling : une (r)évolution dans l'accessibilité du séquençage par nanopore - Abderaouf Hamza, invité par S. Baulande, Institut Curie

11:10 - 11:20 › Validation du séquençage sélectif Nanopore (NAS) chez une espèce maraichère : premiers résultats - Damien Hinsinger, EPGV

11:20 - 11:30 › Questions pour les intervenants

11:30 - 12:15       Session ONT(10min+5min/intervenant), chaired by Stéphane Le Crom, GenomiqueENS

11:30 - 11:45 › Preliminary Results from Nanopore Q20+ Sequencing - Camille Eche, Joanna Lledo, Eden Darnige, GeT PlaGe

11:45 - 12:00 › ONT Q20+ duplex : Tests et évaluation - Stéfan Engelen, Genoscope

12:00 - 12:15 › Améliorations de protocoles de RNAseq en séquençage Oxford Nanopore Technologies, Catherine Sénamaud-Beaufort, Etienne Delannoy, GenomiqueENS et POPS

12:15 - 12:45       Session Single cell (10min+5min/intervenant), chaired by Béatrice Loriod, TGML

12:15 - 12:30 › Transcriptomique en cellule unique sur cellules fixées : test du protocole ACME sur des organismes non-modèles - Catherine Sénamaud-Beaufort, Sophie Lemoine, GenomiqueENS

12:30 - 12:45 › Analysis of single-cell RNA-seq human PBMC datasets - Eric Bonnet, CNRGH

12:45 - 14:00       Déjeuner - Session poster

14:00 - 14:30       Session Spatial transcriptomics (10min+5min/intervenant), chaired by Sylvain Baulande, ICGex

14:00 - 14:15 › Spatial Mapping of Gene Expression to Decipher Thymic Cellular Crosstalk: 10x Genomics Visium Application - Jessica Chevallier, TGML

14:15 - 14:30 › Spatial Isoform Transcriptomics (SiT) - Kevin Lebrigand, UCAGenomiX

14:30 - 15:30       Session Variations génomiques (10min+5min/intervenant), chaired by Pedro Oliveira, Genoscope

14:30 - 14:45 › Développement d'un pipeline d'identification de Variations Structurales dans du reséquençage nanopore de génome complet pour l'identification de mutations dans des maladies rares – Claire Jubin, CNRGH

14:45 - 15:00 › Validation of low-pass sequencing approach for HGDP populations - Christian Daviaud, CNRGH

15:00 - 15:15 › Développement du DRAK-seq (Digital and Restriction-Associated Karyotyping by sequencing) - Stéphanie Rialle, MGX

15:15 - 15:30 › RIMS-seq (Rapid identification of methylase specificity) jointly identifies methylated motifs and generates shotgun sequencing of bacterial genomes – Chloé Baum, Biomics

15:30 - 16:00       Table Ronde R&D et transferts de savoir-faire 

Présentation du Forum Troubleshooting

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