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20-21 juin 2022 PARIS (France)
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Programme AGFG 2022
Lundi 20 Juin 2022
10:00 - 12:30 Session management PFs noyau (avec les Managers des PF du noyau) - Patrick Wincker et Denis Milan 12:30 - 13:30 Déjeuner (seulement pour les managers du noyau) 13:00 - 13:30 Accueil 13:30 - 14:30 France Génomique – Patrick Wincker et Denis Milan 14:30 - 15:30 Présentation des 6 nouvelles PF du réseau (8 min/PF + 2 min de questions) 14:30 - 14:40 › Go@l, Martin Figeac 14:40 - 14:50 › Genomax, Anne Militor 14:50 - 15:00 › iGenSeq, Yannick Marie 15:00 - 15:10 › AuBi, Pierre Peyret 15:10 - 15:20 › ARTbio, Christophe Antoniewski 15:20 - 15:30 › ABIMS, Erwan Corre 15:30 - 15:45 Posters technologiques : présentation « flash » (1min, 1 slide/poster) 15:45 - 16:15 Pause-café 16:15 - 17:15 Session management PFs du réseau (avec les Managers des PFs noyau + associées) Patrick Wincker et Denis Milan 16:15 - 17:15 Session poster en parallèle pour les ingénieurs 17:30 - 19:00 Point développement des PFs (8 min/PF + 2 min de questions) 17:30 - 17:40 › GENTYANE 17:40 - 17:50 › ICGex 17:50 - 18:00 › GenomEast 18:00 - 18:10 › POPS 18:10 - 18:20 › GenomiqueENS 18:20 - 18:30 › PGTB 18:30 - 18:40 › GeT-PlaGe 18:40 - 18:50 › LIGAN 18:50 - 19:00 › CNRGH 19:00 - 20:00 Enregistrement à l'hôtel Ibis Styles Paris Masséna Olympiades - 82 Rue Regnault, 75013 Paris 20:00 - 22:00 Dîner convivial L’Auberge Aveyronnaise – 40 Rue Gabriel Lamé, 75012 Paris Mardi 21 Juin 2022 08:30 - 09:00 Accueil 09:00 - 10:20 Point développement des PFs (8 min/PF + 2 min de questions) 09:00 - 09:10 › Genoscope 09:10 - 09:20 › Biomics 09:20 - 09:30 › MGX 09:30 - 09:40 › Genom’IC 09:40 - 09:50 › PSI2BC 09:50 - 10:00 › ProfileXpert 10:00 - 10:10 › TGML 10:10 - 10:20 › UCAGenomiX 10:20 – 10:50 Pause-café 10:50 - 11:30 Session Adaptive sampling (10min/intervenant), chaired by Cécile Donnadieu, GeT-PlaGe 10:50 - 11:00 › Adaptive sampling development from drylab perspective – Dimitri Desvillechabrol, Biomics 11:00 - 11:10 › L'adaptive sampling : une (r)évolution dans l'accessibilité du séquençage par nanopore - Abderaouf Hamza, invité par S. Baulande, Institut Curie 11:10 - 11:20 › Validation du séquençage sélectif Nanopore (NAS) chez une espèce maraichère : premiers résultats - Damien Hinsinger, EPGV 11:20 - 11:30 › Questions pour les intervenants 11:30 - 12:15 Session ONT(10min+5min/intervenant), chaired by Stéphane Le Crom, GenomiqueENS 11:30 - 11:45 › Preliminary Results from Nanopore Q20+ Sequencing - Camille Eche, Joanna Lledo, Eden Darnige, GeT PlaGe 11:45 - 12:00 › ONT Q20+ duplex : Tests et évaluation - Stéfan Engelen, Genoscope 12:00 - 12:15 › Améliorations de protocoles de RNAseq en séquençage Oxford Nanopore Technologies, Catherine Sénamaud-Beaufort, Etienne Delannoy, GenomiqueENS et POPS 12:15 - 12:45 Session Single cell (10min+5min/intervenant), chaired by Béatrice Loriod, TGML 12:15 - 12:30 › Transcriptomique en cellule unique sur cellules fixées : test du protocole ACME sur des organismes non-modèles - Catherine Sénamaud-Beaufort, Sophie Lemoine, GenomiqueENS 12:30 - 12:45 › Analysis of single-cell RNA-seq human PBMC datasets - Eric Bonnet, CNRGH 12:45 - 14:00 Déjeuner - Session poster 14:00 - 14:30 Session Spatial transcriptomics (10min+5min/intervenant), chaired by Sylvain Baulande, ICGex 14:00 - 14:15 › Spatial Mapping of Gene Expression to Decipher Thymic Cellular Crosstalk: 10x Genomics Visium Application - Jessica Chevallier, TGML 14:15 - 14:30 › Spatial Isoform Transcriptomics (SiT) - Kevin Lebrigand, UCAGenomiX 14:30 - 15:30 Session Variations génomiques (10min+5min/intervenant), chaired by Pedro Oliveira, Genoscope 14:30 - 14:45 › Développement d'un pipeline d'identification de Variations Structurales dans du reséquençage nanopore de génome complet pour l'identification de mutations dans des maladies rares – Claire Jubin, CNRGH 14:45 - 15:00 › Validation of low-pass sequencing approach for HGDP populations - Christian Daviaud, CNRGH 15:00 - 15:15 › Développement du DRAK-seq (Digital and Restriction-Associated Karyotyping by sequencing) - Stéphanie Rialle, MGX 15:15 - 15:30 › RIMS-seq (Rapid identification of methylase specificity) jointly identifies methylated motifs and generates shotgun sequencing of bacterial genomes – Chloé Baum, Biomics 15:30 - 16:00 Table Ronde R&D et transferts de savoir-faire Présentation du Forum Troubleshooting |
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